Category | Symbol | Reaction | Value (s-1) | Ref. |
---|---|---|---|---|
protein dimerization | k 1 | P1 + P1 → P2 | 0.001–0.1 | |
q 1 | P2 → P1 + P1 | 0.1–1 | ||
TF-operator int | k 20 | P2 + D00 → D20 | 0.012 | |
q 20 | D20 → P2 + D00 | 0.9 | ||
k 21 | P1 + D00 → D10 | 0.038 | ||
q 21 | D10 → P1 + D00 | 0.3 | ||
k 22 | P1 + D10 → D20 | 0.011 | ||
q 22 | D20 → P1 + D10 | 0.9 | ||
RNAp-promoter int | k 30 | R + D00 → D01 | 0.038 | |
q 30 | D01 → R + D00 | 0.3 | ||
k 31 | R + D10 → D11 | 0.038†, 0.38‡ | ||
q 31 | D11 → R + D10 | 0.3†, 0.03‡ | ||
k 32 | R + D20 → D21 | 0.38*†| ||
q 32 | D21 → R + D20 | 0.03*†| ||
Isomerization | ν | Dx1 → C + Dx0 | 0.0078 | [55] |
tsx-tsl elongation & decay | α | C → M + R | 0.03 | |
β | M → P1 + M | 0.044 | ||
γ 0 | M → ∅ | 0.0039 | ||
γ 1 | P1 → ∅ | 7 × 10-4 | ||
γ 2 | P2 → ∅ | 0.7–3.5 × 10-4 |