Table 3 Features of clusters predicted by different algorithms on the both the original and C _L networks.

BioGRID

(1)

295

9.58

0.210

0.124

0.78

376

10.41

0.098

0.072

0.40

(2)

296

9.36

0.361

0.155

0.75

647

9.43

0.2411

0.173

0.49

Gavin 6

(1)

155

10.51

0.367

0.203

0.66

160

11.72

0.471

0.194

0.50

(2)

299

9.55

0.401

0.239

0.62

327

9.40

0.486

0.261

0.57

Gavin 2

(1)

110

11.5

0.390

0.118

0.44

115

9.81

0.652

0.252

0.39

(2)

213

9.69

0.417

0.159

0.49

373

9.63

0.479

0.266

0.40

Krogan

(1)

215

8.93

0.251

0.124

0.60

246

8.07

0.146

0.094

0.43

(2)

166

8.15

0.494

0.163

0.64

247

7.77

0.477

0.184

0.54

Ho

(1)

121

8.17

0.206

0.057

0.32

146

8.19

0.486

0.145

0.34

(2)

149

7.89

0.335

0.103

0.45

96

7.28

0.500

0.110

0.36

PCP

RNSC

Avg

Avg

Avg

Avg

PPI

Setting

Cluster

Size

Prec

Recall

Den.

Cluster

Size

Prec

Recall

Den.

BioGRID

(1)

174

8.73

0.253

0.109

0.51

174

6.31

0.367

0.119

0.78

(2)

341

9.27

0.343

0.158

0.60

301

7.36

0.425

0.156

0.81

Gavin 6

(1)

95

9.61

0.463

0.185

0.63

105

6.41

0.381

0.126

0.74

(2)

228

9.14

0.482

0.243

0.62

295

7.33

0.410

0.234

0.72

Gavin 2

(1)

54

9.40

0.537

0.125

0.50

89

5.98

0.370

0.074

0.61

(2)

121

9.17

0.446

0.141

0.45

158

6.81

0.487

0.132

0.59

Krogan

(1)

100

7.90

0.380

0.109

0.61

92

6.25

0.423

0.081

0.72

(2)

205

7.66

0.458

0.158

0.68

200

6.77

0.510

0.165

0.69

Ho

(1)

42

5.59

0.285

0.040

0.29

15

6.85

0.333

0.046

0.41

(2)

51

5.00

0.372

0.060

0.37

26

6.84

0.370

0.073

0.38