From: Modelling biochemical networks with intrinsic time delays: a hybrid semi-parametric approach
Reactor model equations:
d X ( t ) d t = X ( t ) · μ ( W ( t ) ) + D · X ( t )
d S ( t ) d t = − r s ( S ( t ) ) · X ( t ) − D · ( S ( t ) − S F )
d P ( t ) d t = r ρ ( W ( t ) ) · X ( t ) − D · P ( t )
d V ( t ) d t = F ( t )
d W d t = Z − W β
d Z d t = S ( t ) − Z β
F ( t ) = ( V ( t ) S F − S ( t ) ) · ( r s · X ( t ) + S s e t − S ( t ) τ s e t )
D = F V
Cell model equations:
μ = K B 1 · W ( t ) K s + W ( t ) − K B 2 · m A T P
r ρ = K ρ 1 · μ + K ρ 2
r S = r S , m a x ⋅ S ( t ) K s + S ( t )
W ( t ) = ∫ − ∞ t ( S ( t − τ ) / β 2 ) . τ · exp ( − τ / β ) · d τ