Skip to main content

Table 3 Parameter inference result for auto-regulatory gene network model (Partially observed case)

From: Parameter inference for discretely observed stochastic kinetic models using stochastic gradient descent

Datasets k 1 k 2 k 3 k 4 k 5 k 6 k 7 k 8 Average % Err.
  *(0.1 0.7 0.35 0.3 0.1 0.9 0.2 0.1)  
0.102 0.47 0.44 0.214 0.040 0.326 0.400 0.156 46.1
0.090 0.70 0.440 0.348 0.052 0.483 0.263 0.119 24.6
0.125 0.91 0.402 0.316 0.077 0.78 0.230 0.097 16.2
0.188 0.64 0.413 0.250 0.072 0.64 0.43 0.196 49.9
0.078 0.76 0.350 0.300 0.103 0.88 0.188 0.097 5.6
0.108 0.41 0.303 0.247 0.131 0.955 0.214 0.107 16.5
0.079 0.56 0.383 0.332 0.073 0.82 0.228 0.099 14.0
0.123 0.41 0.55 0.386 0.079 0.87 0.213 0.085 24.5
0.103 0.81 0.419 0.421 0.102 1.04 0.142 0.097 16.0
0.075 0.75 0.37 0.30 0.13 0.96 0.25 0.11 13.7
  1. * True values
  2. Datasets D1*-D10* correspond to D1-D10 in Table 3 but with speices mRNA, P and P2 only.
  3. Average % Err. ≡ |k i - k i, true |/k i, true i