BMC Systems Biology

Table 3 Results of parameter estimation of the mammalian G1/S transition network model.

From: Parameter estimation in systems biology models using spline approximation

Parameters	Nominal value	Estimated parameters
		Noise level 0%	Noise level: 2.5%	Noise level: 5%	Noise level: 10%
k ₁	1	0.9957	1.0150	1.1105	1.6037
k ₂	1.6	1.5989	1.4138	1.5187	1.0315
k ₃	0.05	0.0500	0.0528	0.0392	0.0381
k ₁₆	0.4	0.4002	0.4440	0.3959	0.9331
k ₃₄	0.04	0.0400	0.0414	0.0337	0.0215
k ₄₃	0.01	0.0100	0.0142	0.0090	1.45e-10
k ₆₁	0.3	0.2985	0.3432	0.2847	0.8185
k ₆₇	0.7	0.6999	0.4535	1.3974	1.3108
k ₇₆	0.1	0.0999	0.0457	0.2446	0.1845
k ₂₃	0.3	0.1219	0.4134	0.6132	0.5579
k ₂₅	0.9	0.1785	0.7063	0.8291	0.7874
k ₂₈	0.06	0.0601	0.0669	0.0222	0.0198
k ₃₉	0.07	0.0700	0.0549	0.0520	0.0334
k ₉₆	0.01	0.0100	0.0441	0.0002	4.55e-14
a	0.04	0.0400	0.1257	0.1260	0.1265
J ₁₁	0.5	0.4992	0.5612	0.4252	0.6523
J ₁₂	5	5.0025	4.8940	4.6892	5.4021
J ₁₅	0.001	0.0051	0.0011	0.0010	0.0011
J ₁₈	0.6	0.5990	0.7253	0.8014	1.1290
J ₆₁	5	5.2581	4.1474	6.4585	7.2003
J ₆₂	8	8.0088	29.734	39.403	41.408
J ₆₅	6	5.9222	8.7804	9.3474	7.8076
J ₆₈	7	6.9916	31.979	25.125	36.795
J ₁₃	0.002	0.0050	0.0013	0.0016	2.61e-14
J ₆₃	2	1.9740	1.4726	0.4203	19.871
K _m1	0.5	0.4905	0.5267	0.5601	0.0410
K _m2	4	3.9985	4.0482	4.1061	3.8495
K _m4	0.3	0.2999	0.2838	0.2735	0.2338
K _m9	0.005	0.0054	3.69e-5	2.03e-5	3.88e-6
K _p	0.05	0.0499	0.0452	0.0496	0.0311
ϕ ₁	0.005	0.0044	0.0057	0.0041	0.0073
ϕ ₂	0.1	0.0999	0.0920	0.0983	0.0693
ϕ ₃	0.023	0.0230	0.0261	0.0164	0.0152
ϕ ₄	0.03	0.0300	0.0279	0.0253	0.0218
ϕ ₅	0.01	0.0100	0.0098	0.0101	0.0101
ϕ ₆	0.06	0.0606	0.0627	0.0608	0.1518
ϕ ₇	0.04	0.0401	0.0436	0.0404	0.0788
ϕ ₈	0.06	0.0600	0.1546	0.0024	0.0260
ϕ ₉	0.05	0.0500	0.0025	0.0439	0.0276
J		7.5399e-6e	0.0005	0.0009	0.0025

Back to article page

ISSN: 1752-0509

Contact us

General enquiries: ORSupport@springernature.com