Skip to main content

Table 3 Results of parameter estimation of the mammalian G1/S transition network model.

From: Parameter estimation in systems biology models using spline approximation

Parameters Nominal value Estimated parameters
   Noise level 0% Noise level: 2.5% Noise level: 5% Noise level: 10%
k 1 1 0.9957 1.0150 1.1105 1.6037
k 2 1.6 1.5989 1.4138 1.5187 1.0315
k 3 0.05 0.0500 0.0528 0.0392 0.0381
k 16 0.4 0.4002 0.4440 0.3959 0.9331
k 34 0.04 0.0400 0.0414 0.0337 0.0215
k 43 0.01 0.0100 0.0142 0.0090 1.45e-10
k 61 0.3 0.2985 0.3432 0.2847 0.8185
k 67 0.7 0.6999 0.4535 1.3974 1.3108
k 76 0.1 0.0999 0.0457 0.2446 0.1845
k 23 0.3 0.1219 0.4134 0.6132 0.5579
k 25 0.9 0.1785 0.7063 0.8291 0.7874
k 28 0.06 0.0601 0.0669 0.0222 0.0198
k 39 0.07 0.0700 0.0549 0.0520 0.0334
k 96 0.01 0.0100 0.0441 0.0002 4.55e-14
a 0.04 0.0400 0.1257 0.1260 0.1265
J 11 0.5 0.4992 0.5612 0.4252 0.6523
J 12 5 5.0025 4.8940 4.6892 5.4021
J 15 0.001 0.0051 0.0011 0.0010 0.0011
J 18 0.6 0.5990 0.7253 0.8014 1.1290
J 61 5 5.2581 4.1474 6.4585 7.2003
J 62 8 8.0088 29.734 39.403 41.408
J 65 6 5.9222 8.7804 9.3474 7.8076
J 68 7 6.9916 31.979 25.125 36.795
J 13 0.002 0.0050 0.0013 0.0016 2.61e-14
J 63 2 1.9740 1.4726 0.4203 19.871
K m1 0.5 0.4905 0.5267 0.5601 0.0410
K m2 4 3.9985 4.0482 4.1061 3.8495
K m4 0.3 0.2999 0.2838 0.2735 0.2338
K m9 0.005 0.0054 3.69e-5 2.03e-5 3.88e-6
K p 0.05 0.0499 0.0452 0.0496 0.0311
ϕ 1 0.005 0.0044 0.0057 0.0041 0.0073
ϕ 2 0.1 0.0999 0.0920 0.0983 0.0693
ϕ 3 0.023 0.0230 0.0261 0.0164 0.0152
ϕ 4 0.03 0.0300 0.0279 0.0253 0.0218
ϕ 5 0.01 0.0100 0.0098 0.0101 0.0101
ϕ 6 0.06 0.0606 0.0627 0.0608 0.1518
ϕ 7 0.04 0.0401 0.0436 0.0404 0.0788
ϕ 8 0.06 0.0600 0.1546 0.0024 0.0260
ϕ 9 0.05 0.0500 0.0025 0.0439 0.0276
J   7.5399e-6e 0.0005 0.0009 0.0025