Skip to main content

Table 2 Top paths of INH resistance in active sub-networks

From: Identifying co-targets to fight drug resistance based on a random walk model

Top paths in active sub-networks Savg(P)
Antibiotic efflux pumps
kasB--fabD--kasA--efpA--fbpC2--fbpB--ccsA 1.277
kasB--kasA--fadE24--efpA--fbpC2--fbpB--ccsA 1.327
kasB--kasA--efpA--fadE24--echA18'--fbpB--ccsA 1.348
Antibiotic degrading enzymes
fabG1--kasB--acpM--kasA--sigC--blaC 1.247
fabD--kasB--kasA--sigC--blaC 1.299
accD4--accD6--kasB--kasA--sigC--blaC 1.331
fabG1--acpM--accA3--fabD--kasA--sigC--blaC 1.345
SOS response
kasB--kasA--accD6--fadE23--fadE24--echA18'--dnaE2 1.255
accA3--fabD--kasB--kasA--acpM--ruvA--ahpC 1.262
kasB--acpM--accD6--fadE23--fadE24--echA18'--dnaE2 1.284
inhA--kasB--fabD--kasA--acpM--ruvA--ahpC 1.304
inhA--kasA--kasB--accD6--fadE23--echA18'--dnaE2 1.333
fabD--kasB--accD6--fadA2--fadE24--echA18'--dnaE2 1.337
Cytochromes
inhA--kasB--kasA--acpM--gpdA1--fbpB--ccsA 0.961
kasA--kasB--accD6--fadE23--fadD11--fbpB--ccsA 0.964
kasA--kasB--accD6--fadE23--echA7--fbpB--ccsA 0.975
kasA--kasB--accD6--fadE23--echA5--fbpB--ccsA 0.998
kas--acpM--kasB--fabD--atpD--ctaD--aceE 1.214
kasB--acpM--kasA--fabD--ctaD--aceE 1.247
kasA--kasB--acpM--accA3--fabD--ctaD--aceE 1.248