Skip to main content

Table 2 Top paths of INH resistance in active sub-networks

From: Identifying co-targets to fight drug resistance based on a random walk model

Top paths in active sub-networks

Savg(P)

Antibiotic efflux pumps

kasB--fabD--kasA--efpA--fbpC2--fbpB--ccsA

1.277

kasB--kasA--fadE24--efpA--fbpC2--fbpB--ccsA

1.327

kasB--kasA--efpA--fadE24--echA18'--fbpB--ccsA

1.348

Antibiotic degrading enzymes

fabG1--kasB--acpM--kasA--sigC--blaC

1.247

fabD--kasB--kasA--sigC--blaC

1.299

accD4--accD6--kasB--kasA--sigC--blaC

1.331

fabG1--acpM--accA3--fabD--kasA--sigC--blaC

1.345

SOS response

kasB--kasA--accD6--fadE23--fadE24--echA18'--dnaE2

1.255

accA3--fabD--kasB--kasA--acpM--ruvA--ahpC

1.262

kasB--acpM--accD6--fadE23--fadE24--echA18'--dnaE2

1.284

inhA--kasB--fabD--kasA--acpM--ruvA--ahpC

1.304

inhA--kasA--kasB--accD6--fadE23--echA18'--dnaE2

1.333

fabD--kasB--accD6--fadA2--fadE24--echA18'--dnaE2

1.337

Cytochromes

inhA--kasB--kasA--acpM--gpdA1--fbpB--ccsA

0.961

kasA--kasB--accD6--fadE23--fadD11--fbpB--ccsA

0.964

kasA--kasB--accD6--fadE23--echA7--fbpB--ccsA

0.975

kasA--kasB--accD6--fadE23--echA5--fbpB--ccsA

0.998

kas--acpM--kasB--fabD--atpD--ctaD--aceE

1.214

kasB--acpM--kasA--fabD--ctaD--aceE

1.247

kasA--kasB--acpM--accA3--fabD--ctaD--aceE

1.248