TY - JOUR AU - Sotiriou, C. AU - Piccart, M. J. PY - 2007 DA - 2007// TI - Taking gene-expression profiling to the clinic: when will molecular signatures become relevant to patient care? JO - Nat Rev Cancer VL - 7 UR - https://doi.org/10.1038/nrc2173 DO - 10.1038/nrc2173 ID - Sotiriou2007 ER - TY - JOUR AU - Méndez, E. AU - Lohavanichbutr, P. AU - Fan, W. AU - Houck, J. R. AU - Rue, T. C. AU - Doody, D. R. AU - Futran, N. D. AU - Upton, M. P. AU - Yueh, B. AU - Zhao, L. P. AU - Schwartz, S. M. AU - Chen, C. PY - 2011 DA - 2011// TI - Can a metastatic gene expression profile outperform tumor size as a predictor of occult lymph node metastasis in oral cancer patients? JO - Clin Cancer Res VL - 17 UR - https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-10-0175 DO - 10.1158/1078-0432.CCR-10-0175 ID - Méndez2011 ER - TY - JOUR AU - Servant, N. AU - Bollet, M. A. AU - Halfwerk, H. AU - Bleakley, K. AU - Kreike, B. AU - Jacob, L. AU - Sie, D. AU - Kerkhoven, R. AU - Hupe, P. AU - Hadhri, R. AU - Fourquet, A. AU - Bartelink, H. AU - Barillot, E. AU - Sigal-Zafrani, B. AU - Van De Vijver, M. PY - 2012 DA - 2012// TI - Search for a gene expression signature of breast cancer local recurrence in young women JO - Clin Cancer Res VL - 45 UR - https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-11-1954 DO - 10.1158/1078-0432.CCR-11-1954 ID - Servant2012 ER - TY - JOUR AU - Van Veer, L. J. AU - Dai, H. AU - Van De Vijver, M. J. AU - Schreiber, G. J. AU - Kerkhoven, R. M. AU - Roberts, C. AU - Bernards, Â. AU - Friend, S. H. AU - Linsley, P. S. PY - 2002 DA - 2002// TI - Gene expression profiling predicts clinical outcome of breast cancer JO - Nature VL - 415 UR - https://doi.org/10.1038/415530a DO - 10.1038/415530a ID - Van Veer2002 ER - TY - JOUR AU - Paik, S. AU - Shak, S. AU - Tang, G. AU - Kim, C. AU - Baker, J. AU - Cronin, M. AU - Baehner, F. L. AU - Walker, M. G. AU - Watson, D. AU - Park, T. AU - Hiller, W. AU - Fisher, E. R. AU - Wickerham, D. L. AU - Bryant, J. AU - Wolmark, N. PY - 2004 DA - 2004// TI - A multigene assay to predict recurrence of tamoxifen-treated, node-negative breast cancer JO - N Engl J Med VL - 351 UR - https://doi.org/10.1056/NEJMoa041588 DO - 10.1056/NEJMoa041588 ID - Paik2004 ER - TY - JOUR AU - Nevins, J. R. AU - Potti, A. PY - 2007 DA - 2007// TI - Mining gene expression profiles: expression signatures as cancer phenotypes JO - Nat Rev Genet VL - 8 UR - https://doi.org/10.1038/nrg2137 DO - 10.1038/nrg2137 ID - Nevins2007 ER - TY - JOUR AU - Pe’er, D. AU - Hacohen, N. PY - 2011 DA - 2011// TI - Principles and strategies for developing network models in cancer JO - Cell VL - 144 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2011.03.001 DO - 10.1016/j.cell.2011.03.001 ID - Pe’er2011 ER - TY - JOUR AU - Carro, M. S. AU - Lim, W. K. AU - Alvarez, M. J. AU - Bollo, R. J. AU - Zhao, X. AU - Snyder, E. Y. AU - Sulman, E. P. AU - Anne, S. L. AU - Doetsch, F. AU - Colman, H. AU - Lasorella, A. AU - Aldape, K. AU - Califano, A. AU - Iavarone, A. PY - 2010 DA - 2010// TI - The transcriptional network for mesenchymal transformation of brain tumours JO - Nature VL - 463 UR - https://doi.org/10.1038/nature08712 DO - 10.1038/nature08712 ID - Carro2010 ER - TY - JOUR AU - Margolin, A. AU - Wang, K. AU - Lim, W. K. AU - Kustagi, M. AU - Nemenman, I. AU - Califano, A. PY - 2006 DA - 2006// TI - Reverse engineering cellular networks JO - Nat Protoc VL - 1 UR - https://doi.org/10.1038/nprot.2006.106 DO - 10.1038/nprot.2006.106 ID - Margolin2006 ER - TY - JOUR AU - Jemal, A. AU - Bray, F. AU - Center, M. M. AU - Ferlay, J. AU - Ward, E. AU - Forman, D. PY - 2011 DA - 2011// TI - Global cancer statistics JO - CA Cancer J Clin VL - 61 UR - https://doi.org/10.3322/caac.20107 DO - 10.3322/caac.20107 ID - Jemal2011 ER - TY - JOUR AU - Jorissen, R. N. AU - Gibbs, P. AU - Christie, M. AU - Prakash, S. AU - Lipton, L. AU - Desai, J. AU - Kerr, D. AU - Aaltonen, L. A. AU - Arango, D. AU - Kruhøffer, M. AU - Orntoft, T. F. AU - Andersen, C. L. AU - Gruidl, M. AU - Kamath, V. P. AU - Eschrich, S. AU - Yeatman, T. J. AU - Sieber, O. M. PY - 2009 DA - 2009// TI - Metastasis-associated gene expression changes predict poor outcomes in patients with Dukes Stage B and C colorectal cancer JO - Clin Cancer Res VL - 15 UR - https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-09-1431 DO - 10.1158/1078-0432.CCR-09-1431 ID - Jorissen2009 ER - TY - JOUR AU - Smith, J. J. AU - Deane, N. G. AU - Wu, F. AU - Merchant, N. B. AU - Zhang, B. AU - Jiang, A. AU - Lu, P. AU - Johnson, J. C. AU - Schmidt, C. AU - Bailey, C. E. AU - Eschrich, S. AU - Kis, C. AU - Levy, S. AU - Washington, M. K. AU - Heslin, M. J. AU - Coffey, R. J. AU - Yeatman, T. J. AU - Shyr, Y. AU - Beauchamp, R. D. PY - 2010 DA - 2010// TI - Experimentally derived metastasis gene expression profile predicts recurrence and death in patients with colon cancer JO - Gastroenterology VL - 138 UR - https://doi.org/10.1053/j.gastro.2009.11.005 DO - 10.1053/j.gastro.2009.11.005 ID - Smith2010 ER - TY - JOUR AU - Staub, E. AU - Groene, J. AU - Heinze, M. AU - Mennerich, D. AU - Roepcke, S. AU - Klaman, I. AU - Hinzmann, B. AU - Castanos-Velez, E. AU - Pilarsky, C. AU - Mann, B. AU - Brümmendorf, T. AU - Weber, B. AU - Buhr, H. -. J. AU - Rosenthal, A. PY - 2009 DA - 2009// TI - An expression module of WIPF1-coexpressed genes identifies patients with favorable prognosis in three tumor types JO - J Mol Med VL - 87 UR - https://doi.org/10.1007/s00109-009-0467-y DO - 10.1007/s00109-009-0467-y ID - Staub2009 ER - TY - JOUR AU - Oh, S. C. AU - Park, Y. -. Y. AU - Park, E. S. AU - Lim, J. Y. AU - Kim, S. M. AU - Kim, S. -. B. AU - Kim, J. AU - Kim, S. C. AU - Chu, I. -. S. AU - Smith, J. J. AU - Beauchamp, R. D. AU - Yeatman, T. J. AU - Kopetz, S. AU - Lee, J. -. S. PY - 2012 DA - 2012// TI - Prognostic gene expression signature associated with two molecularly distinct subtypes of colorectal cancer JO - Gut VL - 61 UR - https://doi.org/10.1136/gutjnl-2011-300812 DO - 10.1136/gutjnl-2011-300812 ID - Oh2012 ER - TY - JOUR AU - Rankin, E. B. AU - Giaccia a, J. PY - 2008 DA - 2008// TI - The role of hypoxia-inducible factors in tumorigenesis JO - Cell Death Differ VL - 15 UR - https://doi.org/10.1038/cdd.2008.21 DO - 10.1038/cdd.2008.21 ID - Rankin2008 ER - TY - JOUR AU - Majmundar, A. J. AU - Wong, W. J. AU - Simon, M. C. PY - 2010 DA - 2010// TI - Hypoxia-inducible factors and the response to hypoxic stress JO - Mol Cell VL - 40 UR - https://doi.org/10.1016/j.molcel.2010.09.022 DO - 10.1016/j.molcel.2010.09.022 ID - Majmundar2010 ER - TY - JOUR AU - Baba, Y. AU - Nosho, K. AU - Shima, K. AU - Irahara, N. AU - Chan, A. T. AU - Meyerhardt, J. A. AU - Chung, D. C. AU - Giovannucci, E. L. AU - Fuchs, C. S. AU - Ogino, S. PY - 2010 DA - 2010// TI - HIF1A Overexpression is associated with poor prognosis in a cohort of 731 colorectal cancers JO - Am J Pathol VL - 176 UR - https://doi.org/10.2353/ajpath.2010.090972 DO - 10.2353/ajpath.2010.090972 ID - Baba2010 ER - TY - JOUR AU - Pan, J. AU - Mestas, J. AU - Burdick, M. D. AU - Phillips, R. J. AU - Thomas, G. V. AU - Reckamp, K. AU - Belperio, J. a. AU - Strieter, R. M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Stromal derived factor-1 (SDF-1/CXCL12) and CXCR4 in renal cell carcinoma metastasis JO - Mol Cancer VL - 5 UR - https://doi.org/10.1186/1476-4598-5-56 DO - 10.1186/1476-4598-5-56 ID - Pan2006 ER - TY - JOUR AU - Erler, J. T. AU - Bennewith, K. L. AU - Nicolau, M. AU - Dornhöfer, N. AU - Kong, C. AU - Le, Q. -. T. AU - Chi, J. -. T. A. AU - Jeffrey, S. S. AU - Giaccia, A. J. PY - 2006 DA - 2006// TI - Lysyl oxidase is essential for hypoxia-induced metastasis JO - Nature VL - 440 UR - https://doi.org/10.1038/nature04695 DO - 10.1038/nature04695 ID - Erler2006 ER - TY - JOUR AU - Zhong, H. AU - Willard, M. AU - Simons, J. PY - 2004 DA - 2004// TI - NS398 reduces hypoxia-inducible factor (HIF)-1alpha and HIF-1 activity: multiple-level effects involving cyclooxygenase-2 dependent and independent mechanisms JO - Int J Cancer VL - 112 UR - https://doi.org/10.1002/ijc.20438 DO - 10.1002/ijc.20438 ID - Zhong2004 ER - TY - JOUR AU - Outinen, P. A. AU - Sood, S. K. AU - Pfeifer, S. I. AU - Pamidi, S. AU - Podor, T. J. AU - Li, J. AU - Weitz, J. I. AU - Austin, R. C. PY - 1999 DA - 1999// TI - Homocysteine-induced endoplasmic reticulum stress and growth arrest leads to specific changes in gene expression in human vascular endothelial cells JO - Blood VL - 94 ID - Outinen1999 ER - TY - JOUR AU - Maurer, B. AU - Busch, N. AU - Jüngel, A. AU - Pileckyte, M. AU - Gay, R. E. AU - Michel, B. A. AU - Schett, G. AU - Gay, S. AU - Distler, J. AU - Distler, O. PY - 2009 DA - 2009// TI - Transcription factor fos-related antigen-2 induces progressive peripheral vasculopathy in mice closely resembling human systemic sclerosis JO - Circulation VL - 120 UR - https://doi.org/10.1161/CIRCULATIONAHA.109.855114 DO - 10.1161/CIRCULATIONAHA.109.855114 ID - Maurer2009 ER - TY - JOUR AU - Landrette, S. F. AU - Kuo, Y. -. H. AU - Hensen, K. AU - van Waalwijk, B. AU - van Doorn-Khosrovani, S. AU - Perrat, P. N. AU - Van de Ven, W. J. M. AU - Delwel, R. AU - Castilla, L. H. PY - 2005 DA - 2005// TI - Plag1 and Plagl2 are oncogenes that induce acute myeloid leukemia in cooperation with Cbfb-MYH11 JO - Blood VL - 105 UR - https://doi.org/10.1182/blood-2004-09-3630 DO - 10.1182/blood-2004-09-3630 ID - Landrette2005 ER - TY - JOUR AU - Yang, Y. -. S. AU - Yang, M. -. C. W. AU - Weissler, J. C. PY - 2011 DA - 2011// TI - Pleiomorphic adenoma gene-like 2 expression is associated with the development of lung adenocarcinoma and emphysema JO - Lung cancer VL - 74 UR - https://doi.org/10.1016/j.lungcan.2011.02.006 DO - 10.1016/j.lungcan.2011.02.006 ID - Yang2011 ER - TY - JOUR AU - Zheng, H. AU - Ying, H. AU - Wiedemeyer, R. AU - Yan, H. AU - Quayle, S. N. AU - Ivanova, E. V. AU - Paik, J. -. H. AU - Zhang, H. AU - Xiao, Y. AU - Perry, S. R. AU - Hu, J. AU - Vinjamoori, A. AU - Gan, B. AU - Sahin, E. AU - Chheda, M. G. AU - Brennan, C. AU - Wang, Y. A. AU - Hahn, W. C. AU - Chin, L. AU - DePinho, R. A. PY - 2010 DA - 2010// TI - PLAGL2 regulates Wnt signaling to impede differentiation in neural stem cells and gliomas JO - Cancer cell VL - 17 UR - https://doi.org/10.1016/j.ccr.2010.03.020 DO - 10.1016/j.ccr.2010.03.020 ID - Zheng2010 ER - TY - JOUR AU - Furukawa, T. AU - Adachi, Y. AU - Fujisawa, J. AU - Kambe, T. AU - Yamaguchi-Iwai, Y. AU - Sasaki, R. AU - Kuwahara, J. AU - Ikehara, S. AU - Tokunaga, R. AU - Taketani, S. PY - 2001 DA - 2001// TI - Involvement of PLAGL2 in activation of iron deficient- and hypoxia-induced gene expression in mouse cell lines JO - Oncogene VL - 20 UR - https://doi.org/10.1038/sj.onc.1204647 DO - 10.1038/sj.onc.1204647 ID - Furukawa2001 ER - TY - JOUR AU - Mizutani, A. AU - Furukawa, T. AU - Adachi, Y. AU - Ikehara, S. AU - Taketani, S. PY - 2002 DA - 2002// TI - A zinc-finger protein, PLAGL2, induces the expression of a proapoptotic protein Nip3, leading to cellular apoptosis JO - J Biol Chem VL - 277 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.M111431200 DO - 10.1074/jbc.M111431200 ID - Mizutani2002 ER - TY - JOUR AU - Hanks, T. S. AU - Gauss, K. A. PY - 2012 DA - 2012// TI - Pleomorphic adenoma gene-like 2 regulates expression of the p53 family member, p73, and induces cell cycle block and apoptosis in human promonocytic U937 cells JO - Apoptosis VL - 17 UR - https://doi.org/10.1007/s10495-011-0672-3 DO - 10.1007/s10495-011-0672-3 ID - Hanks2012 ER - TY - JOUR AU - Jubb, A. M. AU - Chalasani, S. AU - Frantz, G. D. AU - Smits, R. AU - Grabsch, H. I. AU - Kavi, V. AU - Maughan, N. J. AU - Hillan, K. J. AU - Quirke, P. AU - Koeppen, H. PY - 2006 DA - 2006// TI - Achaete-scute like 2 (ascl2) is a target of Wnt signalling and is upregulated in intestinal neoplasia JO - Oncogene VL - 25 UR - https://doi.org/10.1038/sj.onc.1209382 DO - 10.1038/sj.onc.1209382 ID - Jubb2006 ER - TY - JOUR AU - Zhu, R. AU - Yang, Y. AU - Tian, Y. AU - Bai, J. AU - Zhang, X. AU - Li, X. AU - Peng, Z. AU - He, Y. AU - Chen, L. AU - Pan, Q. AU - Fang, D. AU - Chen, W. AU - Qian, C. AU - Bian, X. AU - Wang, R. PY - 2012 DA - 2012// TI - Ascl2 knockdown results in tumor growth arrest by miRNA-302b-related inhibition of colon cancer progenitor cells JO - PloS one VL - 7 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0032170 DO - 10.1371/journal.pone.0032170 ID - Zhu2012 ER - TY - JOUR AU - Roose, J. PY - 1999 DA - 1999// TI - Synergy between tumor suppressor APC and the -catenin-Tcf4 target Tcf1 JO - Science VL - 285 UR - https://doi.org/10.1126/science.285.5435.1923 DO - 10.1126/science.285.5435.1923 ID - Roose1999 ER - TY - JOUR AU - Waterman, M. L. PY - 2004 DA - 2004// TI - Lymphoid enhancer factor/T cell factor expression in colorectal cancer JO - Cancer Metastasis Rev VL - 23 UR - https://doi.org/10.1023/A:1025858928620 DO - 10.1023/A:1025858928620 ID - Waterman2004 ER - TY - JOUR AU - Nakamura, T. AU - Yamazaki, Y. AU - Hatano, Y. AU - Miura, I. PY - 1999 DA - 1999// TI - NUP98 is fused to PMX1 homeobox gene in human acute myelogenous leukemia with chromosome translocation t(1;11)(q23;p15) JO - Blood VL - 94 ID - Nakamura1999 ER - TY - JOUR AU - Moussa, O. AU - Turner, D. P. AU - Feldman, R. J. AU - Sementchenko, V. I. AU - McCarragher, B. D. AU - Desouki, M. M. AU - Fraig, M. AU - Watson, D. K. PY - 2009 DA - 2009// TI - PDEF is a negative regulator of colon cancer cell growth and migration JO - J Cell Biochem VL - 108 UR - https://doi.org/10.1002/jcb.22371 DO - 10.1002/jcb.22371 ID - Moussa2009 ER - TY - JOUR AU - Steffan, J. J. AU - Koul, H. K. PY - 2011 DA - 2011// TI - Prostate derived ETS factor (PDEF): a putative tumor metastasis suppressor JO - Cancer letters VL - 310 UR - https://doi.org/10.1016/j.canlet.2011.06.011 DO - 10.1016/j.canlet.2011.06.011 ID - Steffan2011 ER - TY - JOUR AU - Benjamini, Y. AU - Hochberg, Y. PY - 1995 DA - 1995// TI - Controlling the false discovery rate: a practical and powerful approach to multiple testing JO - J R Stat Soc B VL - 57 ID - Benjamini1995 ER -