Skip to main content

Table 2 Training errors of models of synthetic systems A, B, C which were created with ANN rate law.

From: Evaluating a common semi-mechanistic mathematical model of gene-regulatory networks

System and Code Training data from synthetic ANN SYSTEM  
  ANN MODEL training error Hill MODEL training error  
  [-1,+1] [-5,+5] [-10,+10] [-20,+20] [-1,+1] [-5,+5] [-10,+10] [-20,+20] x ¯ s
A -1, 0, +1 0.135 0.136 0.135 0.136 0.139 0.140 0.136 0.133 0.136 0.002
B   0.161 0.160 0.160 0.160 0.176 0.163 0.159 0.162 0.163 0.006
C   0.160 0.160 0.160 0.160 0.158 0.160 0.158 0.166 0.160 0.002
A -5, 0, +5 0.137 0.136 0.139 0.137 0.142 0.141 0.136 0.143 0.139 0.003
B   0.128 0.126 0.124 0.124 0.139 0.125 0.126 0.124 0.127 0.005
C   0.152 0.152 0.152 0.152 0.153 0.155 0.151 0.153 0.152 0.001
A -10,0,+10 0.156 0.156 0.156 0.156 0.186 0.160 0.158 0.148 0.160 0.011
B   0.142 0.142 0.142 0.142 0.149 0.150 0.150 0.139 0.144 0.004
C   0.144 0.142 0.142 0.142 0.147 0.150 0.148 0.149 0.146 0.003
A -20,0,+20 0.132 0.136 0.136 0.134 0.141 0.137 0.138 0.131 0.136 0.003
B   0.135 0.137 0.136 0.136 0.137 0.145 0.145 0.136 0.138 0.004
C   0.131 0.130 0.130 0.130 0.132 0.130 0.130 0.131 0.130 0.001
x ¯ 0.143 0.143 0.143 0.143 0.150 0.146 0.145 0.143 ALL ALL
s 0.012 0.012 0.012 0.012 0.017 0.012 0.011 0.013 0.144 0.012