Skip to main content

Table 2 Training errors of models of synthetic systems A, B, C which were created with ANN rate law.

From: Evaluating a common semi-mechanistic mathematical model of gene-regulatory networks

System and Code

Training data from synthetic ANN SYSTEM

 
 

ANN MODEL training error

Hill MODEL training error

 
 

[-1,+1]

[-5,+5]

[-10,+10]

[-20,+20]

[-1,+1]

[-5,+5]

[-10,+10]

[-20,+20]

x ¯

s

A

-1, 0, +1

0.135

0.136

0.135

0.136

0.139

0.140

0.136

0.133

0.136

0.002

B

 

0.161

0.160

0.160

0.160

0.176

0.163

0.159

0.162

0.163

0.006

C

 

0.160

0.160

0.160

0.160

0.158

0.160

0.158

0.166

0.160

0.002

A

-5, 0, +5

0.137

0.136

0.139

0.137

0.142

0.141

0.136

0.143

0.139

0.003

B

 

0.128

0.126

0.124

0.124

0.139

0.125

0.126

0.124

0.127

0.005

C

 

0.152

0.152

0.152

0.152

0.153

0.155

0.151

0.153

0.152

0.001

A

-10,0,+10

0.156

0.156

0.156

0.156

0.186

0.160

0.158

0.148

0.160

0.011

B

 

0.142

0.142

0.142

0.142

0.149

0.150

0.150

0.139

0.144

0.004

C

 

0.144

0.142

0.142

0.142

0.147

0.150

0.148

0.149

0.146

0.003

A

-20,0,+20

0.132

0.136

0.136

0.134

0.141

0.137

0.138

0.131

0.136

0.003

B

 

0.135

0.137

0.136

0.136

0.137

0.145

0.145

0.136

0.138

0.004

C

 

0.131

0.130

0.130

0.130

0.132

0.130

0.130

0.131

0.130

0.001

x ¯

0.143

0.143

0.143

0.143

0.150

0.146

0.145

0.143

ALL

ALL

s

0.012

0.012

0.012

0.012

0.017

0.012

0.011

0.013

0.144

0.012