From: Evaluating a common semi-mechanistic mathematical model of gene-regulatory networks
System and Code | Training data from synthetic ANN SYSTEM | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ANN MODEL training error | Hill MODEL training error | ||||||||||
[-1,+1] | [-5,+5] | [-10,+10] | [-20,+20] | [-1,+1] | [-5,+5] | [-10,+10] | [-20,+20] |
| s | ||
A | -1, 0, +1 | 0.135 | 0.136 | 0.135 | 0.136 | 0.139 | 0.140 | 0.136 | 0.133 | 0.136 | 0.002 |
B | 0.161 | 0.160 | 0.160 | 0.160 | 0.176 | 0.163 | 0.159 | 0.162 | 0.163 | 0.006 | |
C | 0.160 | 0.160 | 0.160 | 0.160 | 0.158 | 0.160 | 0.158 | 0.166 | 0.160 | 0.002 | |
A | -5, 0, +5 | 0.137 | 0.136 | 0.139 | 0.137 | 0.142 | 0.141 | 0.136 | 0.143 | 0.139 | 0.003 |
B | 0.128 | 0.126 | 0.124 | 0.124 | 0.139 | 0.125 | 0.126 | 0.124 | 0.127 | 0.005 | |
C | 0.152 | 0.152 | 0.152 | 0.152 | 0.153 | 0.155 | 0.151 | 0.153 | 0.152 | 0.001 | |
A | -10,0,+10 | 0.156 | 0.156 | 0.156 | 0.156 | 0.186 | 0.160 | 0.158 | 0.148 | 0.160 | 0.011 |
B | 0.142 | 0.142 | 0.142 | 0.142 | 0.149 | 0.150 | 0.150 | 0.139 | 0.144 | 0.004 | |
C | 0.144 | 0.142 | 0.142 | 0.142 | 0.147 | 0.150 | 0.148 | 0.149 | 0.146 | 0.003 | |
A | -20,0,+20 | 0.132 | 0.136 | 0.136 | 0.134 | 0.141 | 0.137 | 0.138 | 0.131 | 0.136 | 0.003 |
B | 0.135 | 0.137 | 0.136 | 0.136 | 0.137 | 0.145 | 0.145 | 0.136 | 0.138 | 0.004 | |
C | 0.131 | 0.130 | 0.130 | 0.130 | 0.132 | 0.130 | 0.130 | 0.131 | 0.130 | 0.001 | |
| 0.143 | 0.143 | 0.143 | 0.143 | 0.150 | 0.146 | 0.145 | 0.143 | ALL | ALL | |
s | 0.012 | 0.012 | 0.012 | 0.012 | 0.017 | 0.012 | 0.011 | 0.013 | 0.144 | 0.012 |