Skip to main content

Table 3 Training errors of models of synthetic systems A, B, C which were created with Hill rate law.

From: Evaluating a common semi-mechanistic mathematical model of gene-regulatory networks

System and Code Training data from synthetic Hill SYSTEM  
  ANN MODEL training error Hill MODEL training error  
  [-1,+1] [-5,+5] [-10,+10] [-20,+20] [-1,+1] [-5,+5] [-10,+10] [-20,+20] x ¯ s
A -1, 0, +1 0.118 0.115 0.120 0.116 0.126 0.119 0.119 0.137 0.121 0.007
B   0.140 0.143 0.143 0.143 0.147 0.141 0.141 0.138 0.142 0.003
C   0.165 0.163 0.164 0.167 0.163 0.162 0.162 0.163 0.163 0.002
A -5, 0, +5 0.252 0.254 0.252 0.252 0.134 0.133 0.134 0.133 0.193 0.064
B   0.230 0.247 0.247 0.247 0.126 0.126 0.127 0.123 0.184 0.063
C   0.348 0.348 0.348 0.348 0.132 0.132 0.131 0.133 0.240 0.116
A -10,0,+10 0.470 0.471 0.470 0.470 0.153 0.152 0.152 0.153 0.311 0.170
B   0.455 0.447 0.443 0.455 0.125 0.125 0.125 0.124 0.287 0.174
C   0.432 0.432 0.432 0.432 0.126 0.112 0.111 0.112 0.274 0.170
A -20,0,+20 0.586 0.586 0.586 0.586 0.194 0.175 0.168 0.168 0.381 0.219
B   0.568 0.568 0.568 0.568 0.141 0.122 0.117 0.116 0.346 0.237
C   0.492 0.492 0.492 0.492 0.194 0.140 0.124 0.123 0.318 0.187
x ¯ 0.355 0.355 0.355 0.356 0.147 0.136 0.134 0.135 ALL ALL
s 0.168 0.167 0.166 0.167 0.025 0.019 0.018 0.018 0.247 0.158