Evaluating a common semi-mechanistic mathematical model of gene-regulatory networks

BMC Systems Biology

Table 4 Validation errors of models of synthetic systems A, B, C which were created with ANN rate law.

System and Code		Validation data from synthetic ANN SYSTEM
		ANN MODEL validation error				Hill MODEL validation error
		[-1,+1]	[-5,+5]	[-10,+10]	[-20,+20]	[-1,+1]	[-5,+5]	[-10,+10]	[-20,+20]	$\bar{x}$	s
A	-1, 0, +1	0.220	0.199	0.193	0.168	0.243	0.397	0.362	0.405	0.273	0.098
B		0.168	0.140	0.166	0.164	0.261	0.166	0.266	0.431	0.220	0.097
C		0.161	0.141	0.148	0.161	0.291	0.353	0.300	0.260	0.227	0.083
A	-5, 0, +5	0.228	0.217	0.216	0.199	0.304	0.382	0.342	0.463	0.294	0.096
B		0.144	0.292	0.133	0.134	0.163	0.177	0.147	0.379	0.196	0.090
C		0.160	0.150	0.141	0.140	0.244	0.254	0.209	0.312	0.201	0.064
A	-10,0,+10	0.163	0.159	0.155	0.198	0.329	0.298	0.255	0.375	0.242	0.086
B		0.198	0.192	0.187	0.188	0.227	0.194	0.198	0.432	0.227	0.084
C		0.144	0.167	0.159	0.181	0.236	0.277	0.265	0.369	0.225	0.077
A	-20,0,+20	0.183	0.209	0.216	0.213	0.313	0.355	0.404	0.426	0.290	0.097
B		0.185	0.174	0.174	0.172	0.178	0.424	0.264	0.212	0.223	0.087
C		0.243	0.186	0.233	0.183	0.303	0.262	0.245	0.418	0.259	0.075
$\bar{x}$		0.183	0.186	0.177	0.175	0.258	0.295	0.271	0.374	ALL	ALL
s		0.033	0.042	0.032	0.024	0.053	0.088	0.072	0.076	0.240	0.087

ISSN: 1752-0509