Skip to main content

Table 4 Validation errors of models of synthetic systems A, B, C which were created with ANN rate law.

From: Evaluating a common semi-mechanistic mathematical model of gene-regulatory networks

System and Code Validation data from synthetic ANN SYSTEM  
  ANN MODEL validation error Hill MODEL validation error  
  [-1,+1] [-5,+5] [-10,+10] [-20,+20] [-1,+1] [-5,+5] [-10,+10] [-20,+20] x ¯ s
A -1, 0, +1 0.220 0.199 0.193 0.168 0.243 0.397 0.362 0.405 0.273 0.098
B   0.168 0.140 0.166 0.164 0.261 0.166 0.266 0.431 0.220 0.097
C   0.161 0.141 0.148 0.161 0.291 0.353 0.300 0.260 0.227 0.083
A -5, 0, +5 0.228 0.217 0.216 0.199 0.304 0.382 0.342 0.463 0.294 0.096
B   0.144 0.292 0.133 0.134 0.163 0.177 0.147 0.379 0.196 0.090
C   0.160 0.150 0.141 0.140 0.244 0.254 0.209 0.312 0.201 0.064
A -10,0,+10 0.163 0.159 0.155 0.198 0.329 0.298 0.255 0.375 0.242 0.086
B   0.198 0.192 0.187 0.188 0.227 0.194 0.198 0.432 0.227 0.084
C   0.144 0.167 0.159 0.181 0.236 0.277 0.265 0.369 0.225 0.077
A -20,0,+20 0.183 0.209 0.216 0.213 0.313 0.355 0.404 0.426 0.290 0.097
B   0.185 0.174 0.174 0.172 0.178 0.424 0.264 0.212 0.223 0.087
C   0.243 0.186 0.233 0.183 0.303 0.262 0.245 0.418 0.259 0.075
x ¯ 0.183 0.186 0.177 0.175 0.258 0.295 0.271 0.374 ALL ALL
s 0.033 0.042 0.032 0.024 0.053 0.088 0.072 0.076 0.240 0.087