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Table 1 Centrality analysis to determine the global properties of the EAPCN model using CytoHubba plug-in in Cytoscape

From: The Arabidopsis phytohormone crosstalk network involves a consecutive metabolic route and circular control units of transcription factors that regulate enzyme-encoding genes

MCC

DMNC

MNC

Degree

EPC

Bottleneck

Eccentricity

Closeness

Radiability

Betweenness

Stress

CC

6.3.-.-

1.2.3.7

6.3.-.-

6.3.-.-

6.3.-.-

2.4.1.-

2.4.1.237

6.3.-.-

2.4.1.-

2.4.1.-

2.4.1.-

1.14.17.4

1.2.3.7

2.8.1.9

1.2.3.7

2.4.1.-

2.4.1.-

1.13.11.51

2.4.1.203

2.4.1.-

2.4.1.237

4.4.1.14

2.4.1.237

2.8.1.9

2.4.1.-

2.4.1.203

2.4.1.-

4.4.1.14

4.4.1.14

1.14.13.-

6.3.-.-

2.4.1.237

6.3.-.-

2.4.1.237

4.4.1.14

1.14.11.13

1.14.11.-

1.14.11.13

1.14.11.-

2.4.1.237

2.4.1.237

1.14.11.-

1.14.11.23

4.4.1.14

4.4.1.14

6.3.-.-

6.3.-.-

2.3.1.74

1.14.13.-

2.1.1.-

1.14.13.-

1.2.3.7

1.2.3.7

1.1.-.-

1.14.13.-

1.2.3.7

1.13.11.51

1.14.11.-

1.13.11.51

6.2.1.-

4.4.1.14

2.4.1.121

2.6.1.5

2.1.1.-

2.6.1.5

1.13.11.-

4.4.1.14

1.13.11.51

1.2.3.7

1.14.11.23

2.4.1.121

1.2.3.7

2.1.1.-

4.4.1.14

2.8.1.9

1.14.11.-

1.13.11.51

4.4.1.14

1.13.11.12

2.6.1.5

2.4.1.121

2.1.1.-

1.14.13.93

2.6.1.5

2.6.1.5

2.3.1.74

2.4.1.203

1.14.11.23

2.4.1.121

1.13.11.12

2.5.1.18

2.4.1.121

2.6.1.5

1.13.11.51

2.4.1.263

6.3.-.-

2.4.1.237

6.2.1.-

1.14.11.13

1.14.13.-

1.14.11.23

2.5.1.18

1.2.4.1

3.1.4.4

2.4.1.263

1.14.13.-

4.1.3.27

2.4.1.203

2.4.1.203

1.13.11.51

2.1.1.-

2.4.1.203

2.1.1.-

1.2.4.1

1.14.99.-

1.14.99.-

3.1.4.4

1.14.13.93

2.6.1.5

2.4.1.121

2.4.1.121

1.14.11.23

2.4.1.121

1.13.11.51

3.1.4.4

1.14.99.-

1.2.3.7

2.4.1.12

1.14.99.-

2.4.1.121

3.1.4.4

1.1.1.288

1.14.11.23

1.1.1.288

4.4.1.14

2.4.1.121

1.14.13.-

2.4.1.237

2.8.1.9

1.14.13.93

2.4.1.12

1.2.3.7

1.14.99.-

2.6.1.57

2.8.1.9

2.6.1.57

2.3.1.74

2.6.1.5

2.8.1.9

1.2.3.7

2.4.1.12

2.4.1.263

1.14.13.93

3.2.1.1

2.4.1.12

1.1.1.-

1.14.11.13

1.1.1.-

6.2.1.-

2.5.1.18

1.14.11.-

2.8.1.9

1.14.11.13

1.14.13.-

4.1.3.27

2.4.1.263

1.14.11.-

1.3.1.-

1.13.11.51

1.3.1.-

1.13.11.51

1.14.99.-

4.1.3.27

2.4.1.203

1.14.13.93

4.1.3.27

1.14.13.-

2.4.1.203

1.13.11.-

2.1.1.-

2.3.1.74

1.14.17.4

1.14.11.23

2.8.1.9

2.4.1.12

2.4.1.12

1.13.11.51

1.14.11.-

1.14.11.-

4.1.3.27

2.5.1.18

1.14.11.-

6.2.1.-

6.3.-.-

1.1.1.288

2.4.1.12

1.14.99.-

1.14.11.13

2.3.1.16

1.14.11.23

1.14.11.23

1.14.99.-

1.14.13.-

1.14.13.-

2.5.1.18

2.4.1.-

2.6.1.57

1.14.11.13

2.6.1.57

1.14.13.93

2.4.1.-

2.1.1.-

2.6.1.57

2.4.1.12

1.2.3.7

4.4.1.14

1.14.99.-

1.14.11.-

1.1.1.-

1.14.13.93

1.14.13.93

2.3.1.16

2.4.1.195

1.13.11.-

2.8.1.9

2.5.1.18

2.1.1.-

1.13.11.51

2.4.1.12

1.14.13.-

1.3.1.-

2.4.1.263

1.13.11.-

2.4.1.195

1.11.1.9

2.8.1.9

1.13.11.-

1.13.11.-

1.14.11.23

2.4.1.-

1.14.13.93

2.6.1.5

1.14.17.4

1.1.1.288

2.4.1.263

1.11.1.9

2.1.1.-

2.6.1.57

2.1.1.-

2.6.1.5

2.6.1.57

1.14.11.23

2.4.1.263

1.13.11.12

1.13.11.12

2.6.1.57

2.4.1.203

2.1.1.-

1.14.11.-

1.1.1.288

1.1.1.288

3.1.4.4

1.11.1.9

1.13.11.12

1.1.1.288

2.5.1.18

2.5.1.18

4.1.3.27

2.3.1.74

2.4.1.121

2.4.1.121

2.5.1.18

2.5.1.18

1.1.1.288

2.8.1.9

2.5.1.18

2.6.1.57

1.2.4.1

1.2.4.1

1.13.11.-

2.5.1.18

6.3.-.-

1.1.-.-

2.3.1.74

3.1.3.57

1.1.1.-

3.1.3.57

1.2.4.1

4.1.3.27

1.14.99.-

1.14.99.-

1.1.1.-

1.1.1.-

1.14.11.23

2.4.1.215

6.2.1.-

1.11.1.9

1.3.1.-

1.2.4.1

1.14.99.-

1.13.11.-

2.4.1.237

2.4.1.237

2.3.1.74

6.2.1.-

2.4.1.215

4.1.1.19

3.1.3.57

1.13.11.12

2.6.1.57

1.1.1.-

2.4.1.237

1.1.1.-

2.4.1.12

2.4.1.12

3.1.4.4

1.3.1.-

4.1.1.19

2.4.1.263

1.11.1.9

2.3.1.16

1.14.11.13

1.3.1.-

2.4.1.12

3.1.4.4

1.14.13.93

1.14.13.93

6.2.1.-

1.1.1.288

2.4.1.263

3.2.1.1

1.1.1.-

4.1.1.19

1.11.1.9

1.1.1.288

1.14.13.93

1.3.1.-

2.3.1.16

2.3.1.16

1.3.1.-

3.1.3.57

3.2.1.1

1.1.1.288

1.3.1.-

2.3.1.74

4.1.1.50

2.4.1.195

2.3.1.16

1.13.11.12

2.4.1.195

2.4.1.195

1.13.11.12

4.1.1.19

1.1.1.288

2.6.1.57

1.13.11.12

6.2.1.-

1.2.4.1

2.3.1.74

2.4.1.195

1.2.4.1

1.11.1.9

1.11.1.9

1.2.4.1

1.11.1.9

2.6.1.57

4.1.3.27

2.3.1.16

1.1.1.-

1.1.-.-

6.2.1.-

1.11.1.9

2.3.1.16

1.1.-.-

1.1.-.-

2.3.1.16

1.13.11.12

4.1.3.27

1.1.1.1

4.1.1.19

1.3.1.-

3.1.4.3

1.1.-.-

1.1.-.-

2.4.1.195

2.4.1.215

2.4.1.215

2.4.1.195

1.14.11.13

1.1.1.1

2.6.1.5

1.2.4.1

2.4.1.203

2.4.1.195

3.1.4.3

2.4.1.215

1.11.1.9

4.1.1.19

4.1.1.19

1.11.1.9

2.3.1.16

2.6.1.5

1.13.11.-

2.4.1.203

1.2.4.1

1.1.1.1

1.14.19.2

4.1.1.19

1.1.-.-

2.4.1.263

2.4.1.263

1.1.-.-

3.1.4.3

1.1.1.-

1.1.1.-

2.4.1.195

2.4.1.195

5.4.4.2

2.4.1.203

2.4.1.263

2.4.1.215

3.2.1.1

3.2.1.1

2.4.1.215

1.14.19.2

5.4.4.2

5.4.4.2

3.2.1.1

3.2.1.1

2.8.1.9

1.13.11.12

3.2.1.1

4.1.1.19

4.1.3.27

4.1.3.27

4.1.1.19

1.1.-.-

2.3.1.74

2.3.1.74

1.1.-.-

1.1.-.-

3.1.3.57

2.3.1.16

4.1.3.27

3.2.1.1

1.1.1.1

1.1.1.1

3.2.1.1

1.2.4.1

4.1.1.50

4.1.1.50

3.1.4.3

3.1.4.3

1.14.19.2

4.1.1.19

1.1.1.1

1.1.1.1

1.13.11.-

1.13.11.-

1.1.1.1

1.14.17.4

3.1.4.3

3.1.4.3

1.14.19.2

1.14.19.2

2.3.1.74

3.2.1.1

1.13.11.-

5.4.4.2

5.4.4.2

5.4.4.2

5.4.4.2

2.4.1.195

3.1.4.4

3.1.4.4

1.14.11.13

1.14.17.4

6.2.1.-

1.1.1.1

5.4.4.2

4.1.1.50

4.1.1.50

4.1.1.50

4.1.1.50

5.4.4.2

3.1.3.57

3.1.3.57

1.14.17.4

1.14.11.13

2.4.1.215

5.4.4.2

4.1.1.50

3.1.4.3

3.1.4.3

3.1.4.3

3.1.4.3

3.2.1.1

6.2.1.-

6.2.1.-

4.1.1.50

1.1.1.1

1.13.11.12

4.1.1.50

3.1.4.3

3.1.3.57

3.1.4.4

3.1.4.4

3.1.3.57

1.1.1.1

1.14.19.2

1.14.19.2

1.1.1.1

5.4.4.2

2.3.1.16

1.14.11.13

3.1.4.4

1.14.19.2

3.1.3.57

3.1.3.57

1.14.19.2

4.1.1.50

1.3.1.-

1.3.1.-

5.4.4.2

4.1.1.50

4.1.1.19

2.4.1.215

3.1.3.57

1.14.17.4

1.14.19.2

1.14.19.2

1.14.17.4

2.4.1.215

1.14.17.4

1.14.17.4

2.4.1.215

2.4.1.215

1.14.17.4

1.14.17.4

1.14.19.2

  1. We have used twelve centrality indices: Maximal Clique Centrality (MCC), Density of Maximum Neighborhood Component (DMNC), Maximum Neighborhood Component (MNC), Degree, Edge Percolated Component (EPC), Bottleneck, Eccentricity, Closeness, Radiability, Betweenness, Stress and Clustering Coefficient (CC) to check which one appears as highly connected nodes. All enzymes have been sorted by default parameters according to 12 different centrality parameters, EC numbers of the enzymes are listed