Skip to main content

Table 1 Validity of our filtering threshold parameters (max,min) of E co (C)

From: Detecting complexes from edge-weighted PPI networks via genes expression analysis

E co (C) |complex| N cp N cb S n PPV Acc Precision Recall F-Measure
(+,0) 1563 739 231 0.5464 0.4887 0.5167 0.4728 0.5662 0.5153
(+,50) 1466 717 225 0.5448 0.4885 0.5159 0.4891 0.5515 0.5184
(80,0) 1563 757 228 0.5641 0.4930 0.5273 0.4843 0.5588 0.5189
(80,40) 1540 754 227 0.5640 0.4929 0.5273 0.4896 0.5564 0.5209
(80,42) 1532 753 226 0.5640 0.4927 0.5272 0.4915 0.5539 0.5209
(80,44) 1519 749 226 0.5635 0.4924 0.5268 0.4931 0.5539 0.5217
(80,46) 1504 746 226 0.5630 0.4922 0.5264 0.4960 0.5539 0.5234
(80,48) 1487 740 223 0.5625 0.4926 0.5264 0.4976 0.5466 0.5210
(80,50) 1466 735 222 0.5625 0.4929 0.5266 0.5014 0.5441 0.5219
(80,52) 1434 728 220 0.5604 0.4937 0.5260 0.5077 0.5392 0.5230
(80,54) 1409 724 219 0.5599 0.4955 0.5267 0.5138 0.5368 0.5251
(80,56) 1375 713 216 0.5583 0.4967 0.5266 0.5185 0.5294 0.5239
(80,58) 1323 697 212 0.5542 0.4986 0.5256 0.5268 0.5196 0.5232
(80,60) 1265 669 206 0.5464 0.5015 0.5234 0.5289 0.5049 0.5166
(70,50) 1466 737 216 0.5688 0.4907 0.5283 0.5027 0.5294 0.5157
(75,50) 1466 735 215 0.5656 0.4916 0.5273 0.5014 0.5270 0.5138
(80,50) 1466 735 222 0.5625 0.4929 0.5266 0.5014 0.5441 0.5219
(85,50) 1466 727 224 0.5547 0.4922 0.5225 0.4959 0.5490 0.5211
(90,50) 1466 723 224 0.5531 0.4913 0.5212 0.4932 0.5490 0.5196
All 1563 756 213 0.5812 0.4871 0.5321 0.4836 0.5221 0.5021