Detecting complexes from edge-weighted PPI networks via genes expression analysis

BMC Systems Biology

Table 1 Validity of our filtering threshold parameters (max,min) of E_co(C)

E_co(C)	\|complex\|	N _cp	N _cb	S _n	PPV	Acc	Precision	Recall	F-Measure
(+∞,0)	1563	739	231	0.5464	0.4887	0.5167	0.4728	0.5662	0.5153
(+∞,50)	1466	717	225	0.5448	0.4885	0.5159	0.4891	0.5515	0.5184
(80,0)	1563	757	228	0.5641	0.4930	0.5273	0.4843	0.5588	0.5189
(80,40)	1540	754	227	0.5640	0.4929	0.5273	0.4896	0.5564	0.5209
(80,42)	1532	753	226	0.5640	0.4927	0.5272	0.4915	0.5539	0.5209
(80,44)	1519	749	226	0.5635	0.4924	0.5268	0.4931	0.5539	0.5217
(80,46)	1504	746	226	0.5630	0.4922	0.5264	0.4960	0.5539	0.5234
(80,48)	1487	740	223	0.5625	0.4926	0.5264	0.4976	0.5466	0.5210
(80,50)	1466	735	222	0.5625	0.4929	0.5266	0.5014	0.5441	0.5219
(80,52)	1434	728	220	0.5604	0.4937	0.5260	0.5077	0.5392	0.5230
(80,54)	1409	724	219	0.5599	0.4955	0.5267	0.5138	0.5368	0.5251
(80,56)	1375	713	216	0.5583	0.4967	0.5266	0.5185	0.5294	0.5239
(80,58)	1323	697	212	0.5542	0.4986	0.5256	0.5268	0.5196	0.5232
(80,60)	1265	669	206	0.5464	0.5015	0.5234	0.5289	0.5049	0.5166
(70,50)	1466	737	216	0.5688	0.4907	0.5283	0.5027	0.5294	0.5157
(75,50)	1466	735	215	0.5656	0.4916	0.5273	0.5014	0.5270	0.5138
(80,50)	1466	735	222	0.5625	0.4929	0.5266	0.5014	0.5441	0.5219
(85,50)	1466	727	224	0.5547	0.4922	0.5225	0.4959	0.5490	0.5211
(90,50)	1466	723	224	0.5531	0.4913	0.5212	0.4932	0.5490	0.5196
All	1563	756	213	0.5812	0.4871	0.5321	0.4836	0.5221	0.5021

ISSN: 1752-0509