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Table 2 Results of Simulation 2

From: Recursive regularization for inferring gene networks from time-course gene expression profiles

   number of time points × number of variables
   20 × 100 20 × 200 20 × 500 20 × 1000 20 × 2000
Method MC TDR SE TDR SE TDR SE TDR SE TDR SE
LA BIC 0.06 0.77 0.05 0.72 0.05 0.69 0.05 0.67 0.05 0.65
LA AICc 0.08 0.78 0.07 0.76 0.07 0.73 0.06 0.71 0.06 0.69
NEN BIC 0.08 0.93 0.07 0.94 0.06 0.91 0.06 0.88 0.06 0.84
NEN AICc 0.12 0.93 0.10 0.93 0.08 0.91 0.08 0.87 0.07 0.83
EN BIC 0.25 0.91 0.19 0.91 0.15 0.89 0.12 0.85 0.11 0.82
EN AICc 0.25 0.91 0.20 0.91 0.15 0.89 0.13 0.85 0.11 0.82
REN BIC 0.74 0.73 0.71 0.70 0.68 0.68 0.65 0.65 0.61 0.61
REN AICc 0.77 0.75 0.73 0.72 0.70 0.69 0.67 0.66 0.63 0.62
CREN BIC 0.54 0.82 0.44 0.81 0.33 0.81 0.27 0.78 0.22 0.76
CREN AICc 0.56 0.82 0.45 0.81 0.34 0.81 0.28 0.78 0.23 0.76
JS-A - 0.09 0.79 0.05 0.74 0.02 0.75 0.01 0.74 4.7 × 10-2 0.74
JS-B - 0.29 0.29 0.19 0.19 0.11 0.10 0.05 0.05 0.03 0.03