Evaluating a common semi-mechanistic mathematical model of gene-regulatory networks

BMC Systems Biology

Table 5 Validation errors of models of synthetic systems A, B, C which were created with Hill rate law.

System and Code		Validation data from synthetic Hill SYSTEM
		ANN MODEL validation error				Hill MODEL validation error
		[-1,+1]	[-5,+5]	[-10,+10]	[-20,+20]	[-1,+1]	[-5,+5]	[-10,+10]	[-20,+20]	$\bar{x}$	s
A	-1, 0, +1	0.163	0.240	0.187	0.223	0.215	0.203	0.190	0.212	0.204	0.024
B		0.173	0.173	0.174	0.171	0.189	0.185	0.195	0.184	0.180	0.009
C		0.259	0.255	0.228	0.193	0.258	0.189	0.263	0.224	0.234	0.030
A	-5, 0, +5	0.398	0.403	0.403	0.403	0.201	0.209	0.203	0.198	0.302	0.106
B		0.292	0.342	0.342	0.298	0.132	0.132	0.133	0.209	0.235	0.094
C		0.386	0.434	0.337	0.435	0.148	0.145	0.148	0.144	0.272	0.138
A	-10,0,+10	0.483	0.481	0.507	0.482	0.163	0.164	0.169	0.171	0.327	0.172
B		0.426	0.423	0.418	0.427	0.132	0.133	0.132	0.134	0.278	0.156
C		0.516	0.556	0.488	0.556	0.165	0.153	0.153	0.152	0.343	0.201
A	-20,0,+20	0.553	0.553	0.552	0.552	0.185	0.167	0.160	0.161	0.361	0.206
B		0.552	0.552	0.552	0.552	0.146	0.135	0.142	0.143	0.347	0.219
C		0.535	0.563	0.563	0.533	0.194	0.138	0.131	0.134	0.349	0.215
$\bar{x}$		0.395	0.415	0.396	0.402	0.177	0.163	0.168	0.172	ALL	ALL
s		0.143	0.137	0.143	0.146	0.037	0.028	0.039	0.032	0.286	0.153

ISSN: 1752-0509