Skip to main content

Table 5 Validation errors of models of synthetic systems A, B, C which were created with Hill rate law.

From: Evaluating a common semi-mechanistic mathematical model of gene-regulatory networks

System and Code Validation data from synthetic Hill SYSTEM  
  ANN MODEL validation error Hill MODEL validation error  
  [-1,+1] [-5,+5] [-10,+10] [-20,+20] [-1,+1] [-5,+5] [-10,+10] [-20,+20] x ¯ s
A -1, 0, +1 0.163 0.240 0.187 0.223 0.215 0.203 0.190 0.212 0.204 0.024
B   0.173 0.173 0.174 0.171 0.189 0.185 0.195 0.184 0.180 0.009
C   0.259 0.255 0.228 0.193 0.258 0.189 0.263 0.224 0.234 0.030
A -5, 0, +5 0.398 0.403 0.403 0.403 0.201 0.209 0.203 0.198 0.302 0.106
B   0.292 0.342 0.342 0.298 0.132 0.132 0.133 0.209 0.235 0.094
C   0.386 0.434 0.337 0.435 0.148 0.145 0.148 0.144 0.272 0.138
A -10,0,+10 0.483 0.481 0.507 0.482 0.163 0.164 0.169 0.171 0.327 0.172
B   0.426 0.423 0.418 0.427 0.132 0.133 0.132 0.134 0.278 0.156
C   0.516 0.556 0.488 0.556 0.165 0.153 0.153 0.152 0.343 0.201
A -20,0,+20 0.553 0.553 0.552 0.552 0.185 0.167 0.160 0.161 0.361 0.206
B   0.552 0.552 0.552 0.552 0.146 0.135 0.142 0.143 0.347 0.219
C   0.535 0.563 0.563 0.533 0.194 0.138 0.131 0.134 0.349 0.215
x ¯ 0.395 0.415 0.396 0.402 0.177 0.163 0.168 0.172 ALL ALL
s 0.143 0.137 0.143 0.146 0.037 0.028 0.039 0.032 0.286 0.153