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Table 1 Features comparison of MetaNET with similar software packages

From: MetaNET - a web-accessible interactive platform for biological metabolic network analysis

Features Installation requirement External dependency GUI Programming knowledge Workflow support Functions
Tools FBA FVA Choke points analysis Chemical species participation
MetaNET N N Y N Y Y Y Y Y
COBRA Y Y N N N Y Y N N
FAME N N Y N N Y Y N N
PathwayAnalyzer Y N N N N Y N N N
Webcoli N N Y N N Y N N N
CellNetAnalyzer Y Y Y N N Y N N N
SBRT N N N Y N Y Y N N
YANA Square Y N Y N N Y N N N
Microbes flux N N Y N N Y N N N
Metatool Y Y N Y N Y N N N
MetanetX N N Y N N Y Y Y N